Exosome 분리 및 정제 프로토콜

Exosome은 세포 간 신호 전달에 중요한 역할을 하는 나노 크기의 소포체(30~150 nm)입니다.

Mesenchymal Stem Cell로부터 Exosome을 효과적으로 분리·정제하기 위해 기본적으로 초고속 원심분리법 (Ultracentrifugation)을 사용하며,

필요에 따라 크기배제 크로마토그래피 (Size-Exclusion Chromatography)나 밀도구배 원심분리법 (Density Gradient Ultracentrifugation)과 같은 추가적인 정제 방법을 사용할 수 있습니다.

 

 




 

 

실험 준비 (시약 및 장비)

 

1.      시약

      PBS (Ca²/Mg² free, 멸균 처리)

      FBS (Exosome-free, Ultracentrifugation 처리된 것 또는 상용 제품 사용)

      MSC 배양배지

2.      장비

      CO₂ 인큐베이터

      초저온 냉동고 (-80°C)

      Centrifuge (4°C 유지 가능)

      Ultracentrifuge

      0.22 µm 필터 (Sterile)

      Nanosight (Nanoparticle tracking analysis, NTA) 또는 TEM (Transmission Electron Microscopy)

      Western blot 또는 ELISA (Exosome 마커 확인용)

      qNano (Exosome 크기 분석용, 옵션)


 


 

 

 

실험 방법

 

1.     MSC 배양 및 배지 준비

     MSC를 FBS-free 또는 Exosome-free FBS를 포함한 배지에서 배양합니다.

     세포가 80~90% confluency에 도달하면 fresh media로 교체하고, 48시간 동안 배양합니다.

     배양 후 배지 상층액 50~200 ml을 수집하여 4°C에서 보관합니다.

2.     Exosome 분리 및 정제 (Ultracentrifugation 기반)

     세포 파편 및 잔여 물질 제거

       300 × g, 10 min, 4°C → 부유 세포 제거

       2,000 × g, 20 min, 4°C → 세포 찌꺼기 제거

       10,000 × g, 30 min, 4°C → Apoptotic body 제거

     Exosome 농축 및 정제

       100,000 × g, 70 min, 4°C → Exosome pellet 생성

       PBS 10 ml로 재부유 후 100,000 × g, 70 min, 4°C

       Pellet을 PBS 200~500 µl에 부유 → Exosome 정제 완료

       0.22 µm 필터를 사용하여 상층액을 여과하여 남은 세포 잔해를 제거 (선택)

       Exosome 샘플을 -80°C에서 보관하거나 즉시 분석

3.      원심분리 시 주의사항

       초고속 원심분리 시 균형을 정확히 맞춰야 합니다.

-       밀리그램 수준까지 동일하게 조정 필요

       Ultra-clear tubes 또는 Polycarbonate tubes 사용을 권장합니다.

-       일반 플라스틱 튜브는 초고속 원심분리에 견디지 못함

       초고속 원심분리 후 Pellet이 거의 보이지 않을 수 있어 조심스럽게 PBS로 재부유합니다.

       원심분리 직후 4°C에서 Exosome을 보관하거나 즉시 분석하는 것을 권장합니다.

4.     Exosome 특성 분석

     단백질 분석 (Exosome Marker 확인)

       Western blot: Exosome 마커 (TSG101, CD63, CD9, CD81) 발현 확인

       ELISA: Exosome 표면 단백질 발현 분석

     크기 및 농도 측정

       Nanoparticle Tracking Analysis (NTA, NanoSight) → Exosome 크기 및 농도 측정

       Dynamic Light Scattering (DLS) → 평균 입자 크기 분석

       Transmission Electron Microscopy (TEM) → Exosome 모양 및 크기 확인

 

 




주의사항

 

       Exosome-free FBS를 사용하지 않으면 FBS 유래 Exosome이 오염될 수 있습니다.

       0.22 µm 필터를 이용해 배양 배지를 사전 여과하면 큰 세포 잔해를 최소화할 수 있습니다.

       원심분리 시 온도 조절(4°C) 필수입니다.

       초고속 원심분리 대신 SEC, PEG-based precipitation 등의 대체 방법을 사용할 수 있습니다.

       Exosome 샘플 보관 시 -80°C에서 보관하는 것이 안정성을 유지하는 데 중요합니다.

 

 


 

 

성공적인 실험을 기원합니다!

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